Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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KCNIP3Q9Y2W7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KCNIP3Q9Y2W7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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