Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF6Q9Y252 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms