Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX7Q9UNH6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms