Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKQ9UM73 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALKQ9UM73 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALKQ9UM73 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALKQ9UM73 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ALKQ9UM73 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ALKQ9UM73 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALKQ9UM73 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALKQ9UM73 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALKQ9UM73 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms