Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC9Q9UKV0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms