Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIMS3Q9UJD0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms