Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XCL2Q9UBD3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms