Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD5Q9P267 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms