Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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