Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC10Q9NYD6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms