Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PGPEP1Q9NXJ5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PGPEP1Q9NXJ5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PGPEP1Q9NXJ5 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PGPEP1Q9NXJ5 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PGPEP1Q9NXJ5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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