Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms