Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms