Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TDP1Q9NUW8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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