Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNX15Q9NRS6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms