Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHST12Q9NRB3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms