Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP4Q9C0A0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms