Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC3Q9BY71 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms