Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD11Q9BXL7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD11Q9BXL7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms