Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THUMPD3Q9BV44 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
THUMPD3Q9BV44 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms