Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM43Q9BTV4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms