Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms