Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPAS2Q99743 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms