Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDRT15Q96T59 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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