Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A9Q96Q91 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms