Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD4Q96M96 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms