Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGLYRP3Q96LB9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGLYRP3Q96LB9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms