Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms