Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC97Q96F63 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms