Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms