Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SIRT1Q96EB6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms