Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms