Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ULK4Q96C45 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ULK4Q96C45 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms