Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTP4Q969X6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms