Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM54Q969K7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms