Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSR2Q969E8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms