Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF4Q8WXU2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms