Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY2Q8WXA3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms