Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms