Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms