Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms