Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYRIPQ8NFW9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms