Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APCDD1LQ8NCL9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms