Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LNX2Q8N448 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LNX2Q8N448 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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