Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms