Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
N4BP2Q86UW6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms