Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms