Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEACAM20Q6UY09 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEACAM20Q6UY09 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms