Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms