Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms